Protein–RNA interactions for Protein: Q92633

LPAR1, Lysophosphatidic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR1Q92633 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LPAR1Q92633 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LPAR1Q92633 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LPAR1Q92633 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LPAR1Q92633 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LPAR1Q92633 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LPAR1Q92633 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms