Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CSRNP3Q8WYN3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CSRNP3Q8WYN3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CSRNP3Q8WYN3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CSRNP3Q8WYN3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CSRNP3Q8WYN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CSRNP3Q8WYN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CSRNP3Q8WYN3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms