Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLEC4DQ8WXI8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLEC4DQ8WXI8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLEC4DQ8WXI8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLEC4DQ8WXI8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLEC4DQ8WXI8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLEC4DQ8WXI8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLEC4DQ8WXI8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms