Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CLEC4DQ8WXI8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CLEC4DQ8WXI8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CLEC4DQ8WXI8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CLEC4DQ8WXI8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLEC4DQ8WXI8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CLEC4DQ8WXI8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CLEC4DQ8WXI8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CLEC4DQ8WXI8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLEC4DQ8WXI8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CLEC4DQ8WXI8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLEC4DQ8WXI8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CLEC4DQ8WXI8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CLEC4DQ8WXI8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLEC4DQ8WXI8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLEC4DQ8WXI8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLEC4DQ8WXI8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLEC4DQ8WXI8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLEC4DQ8WXI8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLEC4DQ8WXI8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLEC4DQ8WXI8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLEC4DQ8WXI8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CLEC4DQ8WXI8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLEC4DQ8WXI8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLEC4DQ8WXI8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLEC4DQ8WXI8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLEC4DQ8WXI8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLEC4DQ8WXI8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLEC4DQ8WXI8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLEC4DQ8WXI8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CLEC4DQ8WXI8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CLEC4DQ8WXI8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLEC4DQ8WXI8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CLEC4DQ8WXI8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLEC4DQ8WXI8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CLEC4DQ8WXI8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CLEC4DQ8WXI8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CLEC4DQ8WXI8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLEC4DQ8WXI8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLEC4DQ8WXI8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CLEC4DQ8WXI8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLEC4DQ8WXI8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CLEC4DQ8WXI8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLEC4DQ8WXI8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLEC4DQ8WXI8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLEC4DQ8WXI8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CLEC4DQ8WXI8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLEC4DQ8WXI8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLEC4DQ8WXI8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLEC4DQ8WXI8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLEC4DQ8WXI8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLEC4DQ8WXI8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLEC4DQ8WXI8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLEC4DQ8WXI8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLEC4DQ8WXI8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLEC4DQ8WXI8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLEC4DQ8WXI8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLEC4DQ8WXI8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLEC4DQ8WXI8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLEC4DQ8WXI8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLEC4DQ8WXI8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLEC4DQ8WXI8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLEC4DQ8WXI8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLEC4DQ8WXI8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLEC4DQ8WXI8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLEC4DQ8WXI8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLEC4DQ8WXI8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLEC4DQ8WXI8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLEC4DQ8WXI8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLEC4DQ8WXI8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CLEC4DQ8WXI8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLEC4DQ8WXI8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLEC4DQ8WXI8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLEC4DQ8WXI8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLEC4DQ8WXI8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLEC4DQ8WXI8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLEC4DQ8WXI8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CLEC4DQ8WXI8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLEC4DQ8WXI8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CLEC4DQ8WXI8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLEC4DQ8WXI8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLEC4DQ8WXI8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLEC4DQ8WXI8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLEC4DQ8WXI8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLEC4DQ8WXI8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLEC4DQ8WXI8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLEC4DQ8WXI8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CLEC4DQ8WXI8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLEC4DQ8WXI8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CLEC4DQ8WXI8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CLEC4DQ8WXI8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLEC4DQ8WXI8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CLEC4DQ8WXI8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CLEC4DQ8WXI8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLEC4DQ8WXI8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLEC4DQ8WXI8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLEC4DQ8WXI8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLEC4DQ8WXI8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLEC4DQ8WXI8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms