Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SPRYD3Q8NCJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SPRYD3Q8NCJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPRYD3Q8NCJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPRYD3Q8NCJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SPRYD3Q8NCJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SPRYD3Q8NCJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms