Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSL3Q8N5Y2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSL3Q8N5Y2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSL3Q8N5Y2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSL3Q8N5Y2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MSL3Q8N5Y2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSL3Q8N5Y2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms