Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEST3Q8N1M1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEST3Q8N1M1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEST3Q8N1M1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEST3Q8N1M1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms