Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LINGO4Q6UY18 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LINGO4Q6UY18 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LINGO4Q6UY18 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINGO4Q6UY18 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINGO4Q6UY18 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms