Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD5Q5TGI4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SAMD5Q5TGI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SAMD5Q5TGI4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms