Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRRT3Q5FWE3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRRT3Q5FWE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRRT3Q5FWE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRRT3Q5FWE3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRRT3Q5FWE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms