Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GNPTABQ3T906 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GNPTABQ3T906 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GNPTABQ3T906 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GNPTABQ3T906 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms