Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PTPRKQ15262 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PTPRKQ15262 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PTPRKQ15262 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
PTPRKQ15262 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
PTPRKQ15262 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
PTPRKQ15262 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
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