Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB33AQ14088 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAB33AQ14088 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAB33AQ14088 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAB33AQ14088 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB33AQ14088 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAB33AQ14088 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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RAB33AQ14088 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB33AQ14088 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAB33AQ14088 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAB33AQ14088 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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RAB33AQ14088 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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RAB33AQ14088 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB33AQ14088 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAB33AQ14088 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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RAB33AQ14088 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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RAB33AQ14088 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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RAB33AQ14088 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAB33AQ14088 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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RAB33AQ14088 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAB33AQ14088 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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RAB33AQ14088 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB33AQ14088 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAB33AQ14088 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB33AQ14088 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAB33AQ14088 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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RAB33AQ14088 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAB33AQ14088 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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