Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TCIRG1Q13488 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TCIRG1Q13488 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TCIRG1Q13488 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TCIRG1Q13488 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TCIRG1Q13488 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TCIRG1Q13488 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TCIRG1Q13488 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TCIRG1Q13488 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TCIRG1Q13488 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TCIRG1Q13488 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TCIRG1Q13488 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TCIRG1Q13488 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TCIRG1Q13488 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TCIRG1Q13488 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
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