Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NFIAQ12857 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NFIAQ12857 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NFIAQ12857 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NFIAQ12857 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFIAQ12857 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFIAQ12857 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
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