Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSG1Q02413 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSG1Q02413 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DSG1Q02413 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DSG1Q02413 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DSG1Q02413 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms