Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT76Q01546 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KRT76Q01546 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT76Q01546 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT76Q01546 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms