Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
HDLBPQ00341 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HDLBPQ00341 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
HDLBPQ00341 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
HDLBPQ00341 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HDLBPQ00341 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HDLBPQ00341 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms