Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCL8P80075 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL8P80075 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL8P80075 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL8P80075 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL8P80075 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL8P80075 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL8P80075 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCL8P80075 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL8P80075 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL8P80075 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL8P80075 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCL8P80075 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL8P80075 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL8P80075 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL8P80075 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL8P80075 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCL8P80075 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL8P80075 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCL8P80075 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL8P80075 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCL8P80075 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL8P80075 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL8P80075 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL8P80075 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL8P80075 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL8P80075 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCL8P80075 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL8P80075 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL8P80075 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL8P80075 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL8P80075 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL8P80075 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL8P80075 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCL8P80075 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL8P80075 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL8P80075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCL8P80075 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL8P80075 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL8P80075 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL8P80075 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL8P80075 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL8P80075 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCL8P80075 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCL8P80075 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL8P80075 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCL8P80075 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL8P80075 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL8P80075 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL8P80075 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL8P80075 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL8P80075 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCL8P80075 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL8P80075 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL8P80075 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL8P80075 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL8P80075 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCL8P80075 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL8P80075 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL8P80075 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL8P80075 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL8P80075 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCL8P80075 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL8P80075 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL8P80075 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL8P80075 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL8P80075 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCL8P80075 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL8P80075 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL8P80075 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL8P80075 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCL8P80075 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL8P80075 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL8P80075 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL8P80075 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCL8P80075 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL8P80075 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL8P80075 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCL8P80075 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL8P80075 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCL8P80075 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL8P80075 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL8P80075 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCL8P80075 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms