Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPNP63162 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPNP63162 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNRPNP63162 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNRPNP63162 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRPNP63162 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms