Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN5P54829 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN5P54829 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPN5P54829 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PTPN5P54829 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPN5P54829 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPN5P54829 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms