Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLK2P49760 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLK2P49760 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLK2P49760 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLK2P49760 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLK2P49760 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLK2P49760 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLK2P49760 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CLK2P49760 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLK2P49760 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLK2P49760 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLK2P49760 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLK2P49760 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CLK2P49760 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLK2P49760 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLK2P49760 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLK2P49760 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLK2P49760 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLK2P49760 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLK2P49760 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLK2P49760 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLK2P49760 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLK2P49760 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLK2P49760 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLK2P49760 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLK2P49760 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLK2P49760 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLK2P49760 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLK2P49760 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLK2P49760 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLK2P49760 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLK2P49760 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLK2P49760 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLK2P49760 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLK2P49760 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLK2P49760 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLK2P49760 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLK2P49760 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLK2P49760 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLK2P49760 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLK2P49760 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLK2P49760 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLK2P49760 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLK2P49760 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLK2P49760 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLK2P49760 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLK2P49760 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLK2P49760 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLK2P49760 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLK2P49760 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLK2P49760 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLK2P49760 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLK2P49760 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLK2P49760 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLK2P49760 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLK2P49760 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLK2P49760 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CLK2P49760 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CLK2P49760 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLK2P49760 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLK2P49760 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLK2P49760 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLK2P49760 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLK2P49760 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLK2P49760 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLK2P49760 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLK2P49760 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLK2P49760 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLK2P49760 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLK2P49760 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLK2P49760 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLK2P49760 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLK2P49760 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLK2P49760 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLK2P49760 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLK2P49760 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLK2P49760 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLK2P49760 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLK2P49760 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLK2P49760 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLK2P49760 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLK2P49760 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLK2P49760 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLK2P49760 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLK2P49760 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLK2P49760 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLK2P49760 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLK2P49760 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLK2P49760 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLK2P49760 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CLK2P49760 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLK2P49760 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLK2P49760 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLK2P49760 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLK2P49760 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLK2P49760 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLK2P49760 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLK2P49760 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLK2P49760 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLK2P49760 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.9 ms