Protein–RNA interactions for Protein: P41595

HTR2B, 5-hydroxytryptamine receptor 2B, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2BP41595 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2BP41595 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HTR2BP41595 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTR2BP41595 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2BP41595 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTR2BP41595 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms