Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRA5P31644 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABRA5P31644 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABRA5P31644 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA5P31644 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA5P31644 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms