Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
DNMT1P26358 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
DNMT1P26358 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
DNMT1P26358 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
DNMT1P26358 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
DNMT1P26358 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
DNMT1P26358 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
DNMT1P26358 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms