Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDCP19113 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDCP19113 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDCP19113 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDCP19113 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDCP19113 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDCP19113 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDCP19113 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDCP19113 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HDCP19113 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDCP19113 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDCP19113 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDCP19113 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDCP19113 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDCP19113 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HDCP19113 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDCP19113 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDCP19113 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDCP19113 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDCP19113 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDCP19113 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HDCP19113 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDCP19113 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDCP19113 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDCP19113 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDCP19113 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDCP19113 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDCP19113 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDCP19113 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDCP19113 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDCP19113 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDCP19113 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDCP19113 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDCP19113 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDCP19113 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDCP19113 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDCP19113 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDCP19113 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDCP19113 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDCP19113 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDCP19113 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HDCP19113 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDCP19113 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDCP19113 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDCP19113 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDCP19113 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDCP19113 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDCP19113 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HDCP19113 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDCP19113 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDCP19113 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDCP19113 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDCP19113 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDCP19113 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HDCP19113 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDCP19113 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDCP19113 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDCP19113 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDCP19113 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDCP19113 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDCP19113 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDCP19113 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDCP19113 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDCP19113 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HDCP19113 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDCP19113 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDCP19113 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HDCP19113 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HDCP19113 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDCP19113 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDCP19113 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDCP19113 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDCP19113 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDCP19113 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDCP19113 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDCP19113 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDCP19113 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDCP19113 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDCP19113 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDCP19113 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDCP19113 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDCP19113 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDCP19113 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDCP19113 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDCP19113 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDCP19113 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDCP19113 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDCP19113 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDCP19113 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDCP19113 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDCP19113 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDCP19113 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDCP19113 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDCP19113 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDCP19113 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDCP19113 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDCP19113 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDCP19113 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDCP19113 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDCP19113 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms