Protein–RNA interactions for Protein: P15169

CPN1, Carboxypeptidase N catalytic chain, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPN1P15169 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPN1P15169 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPN1P15169 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPN1P15169 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPN1P15169 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPN1P15169 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPN1P15169 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CPN1P15169 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CPN1P15169 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPN1P15169 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPN1P15169 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPN1P15169 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPN1P15169 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPN1P15169 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPN1P15169 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPN1P15169 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPN1P15169 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPN1P15169 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPN1P15169 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPN1P15169 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPN1P15169 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPN1P15169 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPN1P15169 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPN1P15169 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPN1P15169 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPN1P15169 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPN1P15169 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPN1P15169 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPN1P15169 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPN1P15169 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPN1P15169 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPN1P15169 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPN1P15169 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPN1P15169 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPN1P15169 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPN1P15169 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPN1P15169 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPN1P15169 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPN1P15169 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPN1P15169 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPN1P15169 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPN1P15169 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPN1P15169 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPN1P15169 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPN1P15169 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPN1P15169 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPN1P15169 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPN1P15169 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPN1P15169 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPN1P15169 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPN1P15169 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPN1P15169 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPN1P15169 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPN1P15169 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPN1P15169 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPN1P15169 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPN1P15169 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPN1P15169 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPN1P15169 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPN1P15169 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPN1P15169 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPN1P15169 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPN1P15169 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPN1P15169 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPN1P15169 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms