Protein–RNA interactions for Protein: P15169

CPN1, Carboxypeptidase N catalytic chain, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPN1P15169 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CPN1P15169 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CPN1P15169 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPN1P15169 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPN1P15169 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CPN1P15169 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CPN1P15169 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CPN1P15169 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPN1P15169 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CPN1P15169 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CPN1P15169 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPN1P15169 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPN1P15169 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CPN1P15169 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPN1P15169 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPN1P15169 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CPN1P15169 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CPN1P15169 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CPN1P15169 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPN1P15169 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPN1P15169 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CPN1P15169 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPN1P15169 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CPN1P15169 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CPN1P15169 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CPN1P15169 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CPN1P15169 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CPN1P15169 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPN1P15169 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPN1P15169 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPN1P15169 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPN1P15169 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPN1P15169 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPN1P15169 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPN1P15169 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPN1P15169 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPN1P15169 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CPN1P15169 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPN1P15169 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPN1P15169 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPN1P15169 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CPN1P15169 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CPN1P15169 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CPN1P15169 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CPN1P15169 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CPN1P15169 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CPN1P15169 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPN1P15169 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPN1P15169 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPN1P15169 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPN1P15169 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPN1P15169 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPN1P15169 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPN1P15169 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPN1P15169 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPN1P15169 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPN1P15169 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPN1P15169 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPN1P15169 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPN1P15169 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPN1P15169 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CPN1P15169 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPN1P15169 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPN1P15169 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPN1P15169 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPN1P15169 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPN1P15169 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPN1P15169 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPN1P15169 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPN1P15169 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPN1P15169 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPN1P15169 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPN1P15169 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPN1P15169 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPN1P15169 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPN1P15169 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPN1P15169 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPN1P15169 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPN1P15169 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPN1P15169 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPN1P15169 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPN1P15169 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CPN1P15169 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CPN1P15169 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CPN1P15169 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CPN1P15169 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPN1P15169 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CPN1P15169 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CPN1P15169 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CPN1P15169 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CPN1P15169 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CPN1P15169 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CPN1P15169 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPN1P15169 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPN1P15169 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CPN1P15169 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CPN1P15169 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CPN1P15169 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CPN1P15169 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CPN1P15169 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms