Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYPP08247 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYPP08247 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYPP08247 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYPP08247 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYPP08247 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYPP08247 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYPP08247 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYPP08247 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYPP08247 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYPP08247 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYPP08247 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYPP08247 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYPP08247 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYPP08247 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYPP08247 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYPP08247 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYPP08247 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYPP08247 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYPP08247 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYPP08247 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYPP08247 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYPP08247 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYPP08247 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYPP08247 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYPP08247 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYPP08247 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYPP08247 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYPP08247 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYPP08247 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYPP08247 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYPP08247 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYPP08247 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYPP08247 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYPP08247 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYPP08247 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYPP08247 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYPP08247 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYPP08247 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYPP08247 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYPP08247 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYPP08247 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYPP08247 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYPP08247 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYPP08247 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYPP08247 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYPP08247 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYPP08247 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYPP08247 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYPP08247 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYPP08247 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYPP08247 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYPP08247 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYPP08247 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYPP08247 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYPP08247 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYPP08247 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SYPP08247 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYPP08247 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYPP08247 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYPP08247 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYPP08247 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYPP08247 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYPP08247 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYPP08247 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYPP08247 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYPP08247 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYPP08247 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYPP08247 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYPP08247 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SYPP08247 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYPP08247 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYPP08247 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYPP08247 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYPP08247 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYPP08247 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYPP08247 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYPP08247 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYPP08247 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYPP08247 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYPP08247 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYPP08247 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYPP08247 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYPP08247 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYPP08247 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYPP08247 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYPP08247 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYPP08247 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYPP08247 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYPP08247 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYPP08247 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYPP08247 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYPP08247 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYPP08247 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYPP08247 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYPP08247 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYPP08247 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYPP08247 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYPP08247 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYPP08247 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms