Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDHAP00338 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LDHAP00338 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LDHAP00338 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDHAP00338 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LDHAP00338 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDHAP00338 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDHAP00338 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDHAP00338 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDHAP00338 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDHAP00338 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDHAP00338 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDHAP00338 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDHAP00338 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDHAP00338 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LDHAP00338 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LDHAP00338 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LDHAP00338 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LDHAP00338 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LDHAP00338 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LDHAP00338 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LDHAP00338 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LDHAP00338 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDHAP00338 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDHAP00338 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDHAP00338 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LDHAP00338 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LDHAP00338 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDHAP00338 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LDHAP00338 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LDHAP00338 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHAP00338 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LDHAP00338 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDHAP00338 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDHAP00338 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LDHAP00338 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHAP00338 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHAP00338 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LDHAP00338 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHAP00338 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHAP00338 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LDHAP00338 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHAP00338 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LDHAP00338 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHAP00338 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHAP00338 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHAP00338 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHAP00338 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LDHAP00338 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHAP00338 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHAP00338 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHAP00338 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LDHAP00338 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LDHAP00338 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHAP00338 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHAP00338 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHAP00338 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHAP00338 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LDHAP00338 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHAP00338 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LDHAP00338 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHAP00338 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LDHAP00338 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LDHAP00338 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHAP00338 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LDHAP00338 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHAP00338 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHAP00338 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHAP00338 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LDHAP00338 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LDHAP00338 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LDHAP00338 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LDHAP00338 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LDHAP00338 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LDHAP00338 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHAP00338 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHAP00338 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LDHAP00338 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDHAP00338 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LDHAP00338 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHAP00338 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHAP00338 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LDHAP00338 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHAP00338 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms