Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT4O95628 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT4O95628 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT4O95628 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT4O95628 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms