Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLDN7O95471 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDN7O95471 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN7O95471 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN7O95471 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN7O95471 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms