Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGDSO95455 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TGDSO95455 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TGDSO95455 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGDSO95455 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGDSO95455 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGDSO95455 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TGDSO95455 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGDSO95455 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGDSO95455 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TGDSO95455 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGDSO95455 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGDSO95455 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TGDSO95455 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGDSO95455 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGDSO95455 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGDSO95455 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TGDSO95455 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TGDSO95455 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGDSO95455 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TGDSO95455 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGDSO95455 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TGDSO95455 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TGDSO95455 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TGDSO95455 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGDSO95455 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGDSO95455 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGDSO95455 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGDSO95455 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGDSO95455 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TGDSO95455 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGDSO95455 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGDSO95455 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGDSO95455 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGDSO95455 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TGDSO95455 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGDSO95455 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGDSO95455 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TGDSO95455 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TGDSO95455 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TGDSO95455 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TGDSO95455 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGDSO95455 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGDSO95455 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGDSO95455 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TGDSO95455 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGDSO95455 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGDSO95455 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGDSO95455 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGDSO95455 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGDSO95455 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TGDSO95455 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TGDSO95455 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TGDSO95455 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGDSO95455 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TGDSO95455 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGDSO95455 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGDSO95455 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TGDSO95455 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGDSO95455 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGDSO95455 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGDSO95455 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TGDSO95455 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGDSO95455 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGDSO95455 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGDSO95455 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGDSO95455 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGDSO95455 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TGDSO95455 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TGDSO95455 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGDSO95455 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGDSO95455 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGDSO95455 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGDSO95455 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGDSO95455 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGDSO95455 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TGDSO95455 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGDSO95455 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGDSO95455 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGDSO95455 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TGDSO95455 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TGDSO95455 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TGDSO95455 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGDSO95455 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGDSO95455 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGDSO95455 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TGDSO95455 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGDSO95455 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGDSO95455 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGDSO95455 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TGDSO95455 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGDSO95455 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGDSO95455 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGDSO95455 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGDSO95455 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGDSO95455 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGDSO95455 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TGDSO95455 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGDSO95455 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TGDSO95455 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms