Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.46■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SYNJ1O43426 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
SYNJ1O43426 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SYNJ1O43426 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SYNJ1O43426 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SYNJ1O43426 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.13■■■■■ 4.5
SYNJ1O43426 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
SYNJ1O43426 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SYNJ1O43426 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms