Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA3O43365 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA3O43365 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA3O43365 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXA3O43365 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms