Protein–RNA interactions for Protein: O43257

ZNHIT1, Zinc finger HIT domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT1O43257 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNHIT1O43257 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNHIT1O43257 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNHIT1O43257 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNHIT1O43257 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT1O43257 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT1O43257 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT1O43257 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT1O43257 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT1O43257 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNHIT1O43257 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT1O43257 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNHIT1O43257 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms