Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
E9PCH4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
E9PCH4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
E9PCH4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
E9PCH4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
E9PCH4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
E9PCH4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
E9PCH4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
E9PCH4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
E9PCH4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
E9PCH4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
E9PCH4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
E9PCH4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
E9PCH4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
E9PCH4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
E9PCH4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
E9PCH4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
E9PCH4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
E9PCH4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
E9PCH4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
E9PCH4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
E9PCH4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
E9PCH4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
E9PCH4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
E9PCH4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
E9PCH4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
E9PCH4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
E9PCH4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
E9PCH4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
E9PCH4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
E9PCH4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
E9PCH4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
E9PCH4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
E9PCH4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
E9PCH4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
E9PCH4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
E9PCH4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
E9PCH4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
E9PCH4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
E9PCH4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
E9PCH4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
E9PCH4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
E9PCH4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
E9PCH4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
E9PCH4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
E9PCH4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
E9PCH4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
E9PCH4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
E9PCH4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
E9PCH4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
E9PCH4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
E9PCH4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
E9PCH4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
E9PCH4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
E9PCH4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
E9PCH4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
E9PCH4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
E9PCH4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
E9PCH4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
E9PCH4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
E9PCH4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
E9PCH4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
E9PCH4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
E9PCH4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
E9PCH4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
E9PCH4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
E9PCH4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
E9PCH4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
E9PCH4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
E9PCH4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
E9PCH4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
E9PCH4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
E9PCH4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
E9PCH4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
E9PCH4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
E9PCH4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
E9PCH4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
E9PCH4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
E9PCH4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
E9PCH4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
E9PCH4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
E9PCH4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
E9PCH4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
E9PCH4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
E9PCH4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
E9PCH4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
E9PCH4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
E9PCH4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
E9PCH4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
E9PCH4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
E9PCH4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
E9PCH4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
E9PCH4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
E9PCH4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
E9PCH4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
E9PCH4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
E9PCH4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
E9PCH4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
E9PCH4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
E9PCH4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms