Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IDSB3KWA1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IDSB3KWA1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IDSB3KWA1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IDSB3KWA1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms