Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UPK3BL1B0FP48 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPK3BL1B0FP48 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPK3BL1B0FP48 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UPK3BL1B0FP48 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms