Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USP17L5A8MUK1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L5A8MUK1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
USP17L5A8MUK1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L5A8MUK1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L5A8MUK1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L5A8MUK1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms