Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTMR11A4FU01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTMR11A4FU01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MTMR11A4FU01 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MTMR11A4FU01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTMR11A4FU01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms