Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPIPA1Q9UND3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPIPA1Q9UND3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NPIPA1Q9UND3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NPIPA1Q9UND3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms