Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNPO2Q9UMS6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNPO2Q9UMS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SYNPO2Q9UMS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYNPO2Q9UMS6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SYNPO2Q9UMS6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYNPO2Q9UMS6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms