Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SUCLA2Q9P2R7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUCLA2Q9P2R7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUCLA2Q9P2R7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUCLA2Q9P2R7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SUCLA2Q9P2R7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SUCLA2Q9P2R7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms