Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ING3Q9NXR8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ING3Q9NXR8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ING3Q9NXR8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ING3Q9NXR8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ING3Q9NXR8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.4 ms