Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF19Q9NS68 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TNFRSF19Q9NS68 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNFRSF19Q9NS68 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNFRSF19Q9NS68 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms