Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP13A2Q9NQ11 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP13A2Q9NQ11 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP13A2Q9NQ11 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP13A2Q9NQ11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms