Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4BQ9NPR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4BQ9NPR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4BQ9NPR2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA4BQ9NPR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms