Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BCAS3Q9H6U6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCAS3Q9H6U6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAS3Q9H6U6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCAS3Q9H6U6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCAS3Q9H6U6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAS3Q9H6U6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms