Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CELF4Q9BZC1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CELF4Q9BZC1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CELF4Q9BZC1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CELF4Q9BZC1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CELF4Q9BZC1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CELF4Q9BZC1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms